Un étang de natation est très facile à entretenir. Les paniers des skimmers doivent être régulièrement nettoyés, en particulier pendant la période de chute des feuilles. Il suffit de vider le panier intégré dans le skimmer.

Si le système de filtration est équipé d'un tamis courbé, il faudra généralement le nettoyer toutes les 3 semaines. Les saletés s'enlèvent facilement avec un couteau à palette.

Si l'étang de natation est construit selon le principe « upflow », une pompe vide-cave permet de nettoyer la zone creuse située en dessous du lagunage. Cette opération s'effectue au maximum deux fois par an.

Les plantes doivent être coupées une fois par an. Munissez-vous d'une solide épuisette pour retirer les branches et les feuilles tombées dans l'eau.  Un aspirateur pour étang peut s'avérer un outil très utile.